В мире, где Япония постоянно подвергается нашествию гигантских монстров, известных как кайдзю, разрушающих города и сеющих хаос, человечество создало специальные Силы обороны. Эти отряды, состоящие из лучших бойцов, борются с кайдзю и защищают мирных жителей от их разрушительных атак.

Кафка Хибино, 32-летний мужчина, с детства мечтал стать частью этих сил и посвятить свою жизнь защите человечества. Однако, несмотря на все его усилия, он не смог пройти вступительные экзамены и осуществить свою мечту. Вместо этого, он устроился на работу в специальную службу, занимающуюся уборкой последствий сражений с кайдзю. Эта работа, хоть и опасная, требует от него не только физической силы, но и высокой концентрации, ведь даже после смерти кайдзю их тела могут представлять угрозу из-за токсичных веществ и биологических опасностей.

Однажды, во время очередной уборки, жизнь Кафки кардинально изменилась. Он столкнулся с необычным существом, напоминающим паразита, который внезапно атаковал его и проник в его тело. Этот инцидент открыл перед ним новые возможности и угрозы, которые он никогда не мог себе представить.