События фильма разворачиваются вскоре после завершения строительства космического лифта «Эндимион» в Академия-Сити. Главный герой [character=13700]Тома Камидзё[/character] и его верная подруга [character=13699]Индекс[/character] случайно встречают [character=72645]Арису Мэйго[/character], эспером нулевого уровня. Несмотря на её невыдающиеся способности, [character=72645]Ариса[/character] становится неожиданным источником беспокойства для «Ассоциации магов», которая начинает преследовать её и нападает на Академия-Сити. Чтобы защитить город от внезапной угрозы, формируется движение сопротивления, во главе которого встаёт [character=72647]Шатаура Секвенция[/character]. Вместе с [character=13700]Томой[/character] и [character=13699]Индекс[/character], они пытаются разобраться в причинах такого резкого поворота событий.

По мере развития сюжета, главные герои узнают от [character=13915]Стэйла Магнуса[/character], что [character=72645]Ариса Мэйго[/character] может стать ключевым элементом в разжигании войны между миром Магии и миром Науки. [character=13915]Стэйл[/character] раскрывает, что «Ассоциация магов» видит в [character=72645]Арисе[/character] потенциальное оружие, способное переломить ход конфликта. В то время как [character=13700]Тома[/character] и [character=13699]Индекс[/character] пытаются защитить [character=72645]Арису[/character] от опасностей, они также сталкиваются с необходимостью противостоять «Ассоциации магов» и её агентам, которые готовы на всё, чтобы использовать [character=72645]Арису[/character] в своих целях.

В этом напряжённом противостоянии, [character=13700]Тома Камидзё[/character] и его друзья понимают, что их миссия не просто защитить [character=72645]Арису Мэйго[/character], но и предотвратить глобальный конфликт. [character=72647]Шатаура Секвенция[/character] и его отряд сопротивления становятся неотъемлемой частью этой борьбы, предлагая свои уникальные способности и стратегии. Вместе они пытаются раскрыть тайны «Ассоциации магов» и предотвратить катастрофу, которая угрожает как миру Магии, так и миру Науки. С каждым шагом, [character=13700]Тома[/character] и его друзья сталкиваются с новыми вызовами, но их решимость защитить [character=72645]Арису[/character] и предотвратить войну только крепнет.