Наступает декабрь, и глава клуба SOS, Судзумия Харухи, решает, что Рождество будет проведено в комнате клуба с рождественским ужином. Все члены клуба с энтузиазмом принимаются за подготовку к этому празднику. Однако, за несколько дней до Рождества, Кён начинает замечать странности в окружающем его мире. Разговоры с Танигути становятся невнятными, а сам он внезапно заболевает и не помнит прошлых бесед. В классе нет Харухи, а Рёко Асакура, которая должна быть мертвой, сидит на её месте и ведет себя как ни в чём не бывало.

Кён пытается разобраться в происходящем, но каждый шаг приводит его к новым загадкам. Микуру Асахина, которая всегда была его подругой, теперь не узнает его. А Нагато, таинственная девушка с невероятными способностями, оказывается обычной участницей литературного клуба. Все эти странности заставляют Кёна задуматься: а существует ли вообще бригада SOS, и была ли Харухи на самом деле?

В поисках ответов Кён погружается в пучину загадок и тайн, которые окружают его. Он понимает, что мир, в котором он живет, не такой уж и простой. Каждый шаг к разгадке приближает его к истине, но также и к новым вопросам. Кён должен найти способ вернуть все на свои места и понять, что же на самом деле произошло с его друзьями и клубом SOS. В этом путешествии по лабиринтам памяти и реальности, Кён узнает много нового о себе и о тех, кто его окружает.