В центре сюжета аниме "Тайо и тайна мафии" — Тайо Асано, застенчивый школьник, и его давняя подруга Муцуми Йозакура. Их дружба переживает сложный период, ведь Муцуми скоро покинет город. Однако Тайо узнает шокирующую правду: Муцуми и ее семья — члены влиятельной мафиозной семьи. Когда враждебная организация объявляет охоту на Йозакуру, Тайо решает рискнуть всем, чтобы защитить Муцуми. Вместе они вступают в смертельную игру, где каждый шаг может стать последним.

Тайо узнает, что отец Муцуми — глава мафиозной группировки "Семейка Йозакура". После убийства главы семьи, Муцуми и Тайо вынуждены бежать. Тайо принимает предложение от конкурирующей мафии о сотрудничестве, чтобы уничтожить "Семейку Йозакура". Он начинает жестокие тренировки, готовясь к битве. Но по мере подготовки, Тайо и Муцуми начинают сомневаться в правильности своих действий. Им предстоит выбор: остаться верными друг другу или продолжить путь мести.

В этой истории о дружбе и предательстве, Тайо и Муцуми сталкиваются с непреодолимыми преградами. Их путь наполнен опасностями, но их связь становится источником силы. Вместе они должны найти способ противостоять мафиозным группировкам и защитить своих близких. "Тайо и тайна мафии" — это история о выборе, верности и неожиданных союзниках, которые помогут им выстоять в этой смертельной игре.