Кайто Куроба снова бросает вызов судьбе, отправляя загадочную записку о предстоящей краже. На этот раз его целью становится легендарный топаз "Мать кристаллов" — самое ценное сокровище империи Инграм. Словно маг, он манипулирует событиями, заставляя мир дрожать от ожидания его следующего акта.

Сэлизабет, уже однажды столкнувшаяся с Куробой, решает не дать ему уйти с драгоценностью во второй раз. Она прячет топаз в тайне, оставляя лишь загадочные следы. В то же время, маленький принц Филипп, жаждущий одобрения матери, вступает в гонку с временем, чтобы поймать хитрого преступника. Вокруг всё больше загадок и интриг, словно паутина, сплетающаяся вокруг каждого персонажа.

Но этот поезд не просто средство передвижения — он становится ареной для противостояния. На борту, помимо великого детектива Эдогавы Конана и инспектора Накаморе, оказываются и другие игроки: опасные преступники Змея и Роза. Каждый преследует свои цели, и никто не знает, кто станет победителем в этой схватке. Сможет ли Кайто Куроба обмануть не только королеву, но и своих смертельных врагов, чтобы заполучить желанную драгоценность? Ответ скрыт в сердце поезда, где каждый вагон хранит свой секрет.