Давным-давно, чтобы защитить Великобританию и её королеву от угрозы вампиров и темных сил, англиканская церковь учредила организацию «Хеллсинг». Эту мощную структуру возглавил Королевский орден протестантских рыцарей. В наши дни организацией руководит Интегра Хеллсинг, которая распоряжается не только отрядами специальных солдат, но и одним из самых могущественных вампиров — Алукардом. Его предки Интегры победили в прошлом, и с тех пор он дал клятву служить семье Хеллсинг.

Помимо выполнения основных задач, Интегра постоянно отбивает нападения старых врагов «Хеллсинга» — 13-го сектора Ватикана и его последователей. В то же время, на улицах городов появляются новые, особенные вампиры, созданные с помощью специальных микрочипов. Эта новая, таинственная сила, по всей видимости, имеет своей целью Англию, «Хеллсинг» и Алукарда. С каждым днем атаки нежити становятся всё более частыми, и Интегра узнаёт о фашистской группировке «Миллениум», стремящейся возродить Третий рейх и создать армию вампиров.

В конечном итоге, на улицах Лондона разворачивается война между тремя организациями. «Миллениум» заявляет о своей главной цели: победить Алукарда, конфликт с которым тянется со времён Второй мировой войны, и одновременно захватить Англию. Интегра Хеллсинг и её верные союзники стоят на защите своей страны, готовые противостоять любой угрозе, чтобы сохранить мир и порядок.