Год 0093 Вселенского Века. В это время мир снова погружается в хаос, когда печально известный Чар Азнабль, известный как Красная Комета, возвращается из тени. Его имя уже давно ассоциируется с кровопролитием и разрушениями, оставленными во время Одногодичной Войны. Теперь, с новым рвением и ненасытной жаждой власти, он возглавляет армию Нео-Зеона, готовясь к новой, ещё более кровавой кампании против Федерации Земли.

Чар Азнабль, несмотря на свой возраст, не теряет ни грамма своей харизмы и стратегического гения. Он планирует масштабное наступление, которое должно привести к коренному изменению баланса сил во Вселенском Веке. Его главным оружием станет астероид «Ось», который, по его замыслу, должен обрушиться на Землю, вызвав катастрофу невиданных масштабов. Таким образом, он надеется не только ослабить Федерацию, но и навсегда изменить облик человечества.

Однако у Чар Азнабля есть злейший враг, который не позволит ему осуществить свой план. Этим врагом является пилот Амуро Рэй, человек, чья жизнь также была перечеркнута войной. Амуро, известный своей храбростью и мастерством, готов бросить вызов Чар Азнаблю и его армии Нео-Зеона. В этом противостоянии, где стратегия сталкивается с инстинктом выживания, Амуро должен не только защитить Землю, но и разобраться со своими собственными демонами, чтобы остановить Красную Комету раз и навсегда.