Жизнь Такаши Нацумэ продолжает быть переплетением человеческих и ёкайских судеб. Однажды он неожиданно встречает своего давнего друга Юки [結城 大輔]. Эта встреча пробуждает в юноше мучительные воспоминания о неком ёкае, который когда-то вторгался в его жизнь. Однако, встреча со старой подругой бабушки — Йориэ Цумурой [津村 容莉枝], приносит Нацумэ не только новые знания, но и помогает ему забыть о прошлых страданиях. Этот новый этап в жизни Нацумэ омрачается лишь присутствием ёкая из его далекого прошлого.

В саду семьи Фудживара происходит что-то необъяснимое. Таинственное семя ёкая внезапно прорастает за одну ночь, превращаясь во фруктовое дерево. Плод с этого дерева съедает Нянко [斑], и вдруг телохранитель Нацумэ начинает распадаться на части! Это событие ставит под угрозу не только безопасность Нацумэ, но и саму гармонию между миром людей и ёкаев. Теперь Нацумэ должен разобраться в происходящем, чтобы предотвратить катастрофу.

В поисках ответов Нацумэ обращается к своим старым знакомым и новым союзникам. Вместе они пытаются раскрыть тайну семени и дерева, которое появилось в саду. В процессе расследования Нацумэ понимает, что его прошлое и настоящее тесно связаны, и что решение этой загадки может изменить его жизнь навсегда. Впереди его ждут испытания, которые проверят не только его силу, но и его веру в себя и своих друзей.