Прошло три года с тех пор, как «Ямато» вернулся с планеты Искандер. Земляне, наконец, восстановили контроль над своей планетой после Космореверса и заключили мирный договор с Гамилусом. В этот период был создан новый оборонный флот, включающий в себя передовой броненосец «Андромеда». Несмотря на протесты [character=59143]Старши[/character], Земля продолжает продвигаться по пути военной экспансии. «Ямато», хоть и помогает достичь «мира», но ценой огромного количества жизней.

Тем временем богиня [character=42962]Тереза[/character], которая молится о спокойствии во вселенной, призывает «Ямато» к новому плаванию. Её предчувствие не обманывает: угроза со стороны Гатлантиса нарастает, охватывая всю вселенную и приближаясь к Земле. Тереза видит, что только «Ямато» может противостоять этой новой угрозе, но для этого кораблю предстоит пройти через множество испытаний и преодолеть собственные слабости.

В этом новом приключении «Ямато» столкнется с неожиданными союзниками и могущественными врагами. Команда корабля, ведомая [character=59143]Старши[/character], должна будет сделать сложный выбор между следованием приказам и собственными убеждениями. Тереза, как истинный страж мира, будет надеяться на то, что «Ямато» сможет остановить Гатлантис и предотвратить новую войну. Но сможет ли Земля и её флот справиться с этой новой угрозой, или это будет конец их мечты о мире?