В центре сюжета аниме находится Мати Амаядори, юная ученица средней школы, которая также является преданной жрицей медвежьего бога. Её жизнь полна традиций и ритуалов, связанных с храмом, где она служит. Однако, помимо своих религиозных обязанностей, Мати заботится о Нацу, могучем медведе, обитающем в глубинах гор Тохоку. Нацу — не просто зверь, а говорящий опекун, который оберегает Мати и помогает ей в её повседневных делах. Эта необычная дружба становится основой для многих комичных и трогательных моментов, раскрывающих культуру и традиции северного региона Японии.

Стремясь к новым знаниям и опыту, Мати решает отправиться в городскую школу, чтобы научиться жить вне стен храма. Это решение не только меняет её жизнь, но и ставит перед ней множество новых вызовов. Нацу, осознавая важность этого шага для Мати, даёт ей ценные советы и указания, которые помогут ей адаптироваться к городской жизни. Вместе они проходят через множество забавных и тревожных ситуаций, которые заставляют Мати взглянуть на мир с совершенно новой точки зрения. Это путешествие становится не только поиском новых знаний, но и глубоким самопознанием.

Аниме "Мати и Нацу" — это не просто история о жизни в храме и городе, а глубокая драма о росте и изменениях. Мати, с одной стороны, стремится сохранить свои традиции и связь с природой, а с другой — открывает для себя мир города, полный новых возможностей и вызовов. Нацу, как её верный друг и наставник, помогает ей на этом пути, сохраняя баланс между старой и новой жизнью. Вместе они показывают, как важно сохранять связь с прошлым, одновременно развиваясь и адаптируясь к будущему. Эта история заставляет зрителей задуматься о ценности традиций и важности изменений в жизни каждого человека.