В отдаленном будущем человечество покинуло разрушенную и отравленную Землю, отправившись в глубины космоса. Однако, по непонятным причинам, экспедиция провалилась, и людям пришлось вернуться на родную планету. К их удивлению, большая часть Земли, кроме территории Японии, стала непригодной для жизни. Чтобы разместить всех, вокруг Японии были созданы специальные зоны. В поисках способа вернуться в космос, началась реконструкция истории человечества, основанная на текстах священной книги "Завета". Но в 1431 году эпохи реконструкции, население этих зон восстало и захватило Японию, разделив её на феодальные владения и вынудив коренных жителей уйти.

Сейчас, в 1648 году эры реконструкции, беженцы обитают в городе-корабле, который непрерывно дрейфует над континентом, покинутой родиной. Под наблюдением Союза реконструкции, они ищут способ вернуть себе историческую родину. В это время ходят слухи о грядущем апокалипсисе и войне, что заставляет Союз приостановить реконструкцию и попытаться понять, что ждет мир после 1648 года.

Воспользовавшись этим затишьем, Тори Аой, руководитель академии Высшей Федерации и президент студенческого совета, решает воспользоваться моментом. Она собирает своих сокурсников и начинает борьбу за возвращение исторической родины. Их путь будет полон опасностей и испытаний, но Тори верит, что только они могут изменить судьбу своего народа и вернуть ему утраченное.