Тадаясу Саваки, первокурсник сельскохозяйственного колледжа, обладает уникальной способностью — он может видеть бактерии, микробы и другие микроскопические организмы, которые обычно невидимы для человеческого глаза. Эта особенность делает его похожим на живой микроскоп, позволяя ему наблюдать за миром микробов, который остается тайной для большинства людей. Его мир переворачивается с ног на голову, когда один из преподавателей колледжа узнает о его необычном даре.

Преподаватель, увлеченный наукой и исследованиями, немедленно видит в Тадаясу потенциал для уникальных экспериментов. Он приглашает Тадаясу и его лучшего друга, Кэя Юки, принять участие в своих исследованиях. Хотя эти исследования кажутся интересными, они далеки от обычных студенческих проектов. Тадаясу и Кэя оказываются втянутыми в мир, где микробы становятся не просто объектами изучения, а активными участниками событий.

Вместе с преподавателем они начинают изучать поведение и взаимодействие различных видов бактерий и микроорганизмов. Это путешествие в мир микробов становится для Тадаясу и Кэя не только научным приключением, но и личным испытанием. Они узнают, что мир микроорганизмов гораздо сложнее и интереснее, чем можно было представить. В процессе исследований они сталкиваются с неожиданными открытиями и вызовами, которые меняют их взгляд на окружающий мир и самих себя.