В 2012 году Япония оказалась на грани катастрофы, когда на её земли вторглись Мю — загадочные существа, напоминающие людей, но с голубой кровью. Пришельцы прибыли из параллельного мира, и их появление стало началом новой эры хаоса и страха. В 2015 году эти незваные гости обрушились на Токио, но их натиск был остановлен мощным гуманоидным оружием, известным как «долем». В это время юный Аято Камина сталкивается с событиями, которые перевернут его жизнь с ног на голову.

Во время одной из таких атак Аято встречает свою одноклассницу Рэйку Мисиму. Их встреча неожиданно прерывается, когда Аято становится мишенью людей правительства. В этот критический момент на помощь приходит женщина по имени Харука Сито, которая представляется агентом организации «TERRA». Она раскрывает Аято шокирующую правду: Токио был запечатан во временном разрыве, где течение времени отличается от остального мира. Время здесь течёт в три раза медленнее, создавая иллюзию застывшего мира. Аято, пытаясь скрыться от Харуки, бежит на поезд, где неожиданно снова встречает Рэйку.

Прибыв в таинственный Зал Ра, Аято следует за Рэйкой к огромному яйцу, из которого появляется долем Ра-Зефон. В этот момент на вершине долема неожиданно появляется мать Аято, которая останавливает вторжение «TERRA». Однако в ходе битвы она получает серьёзное ранение, и, увидев её голубую кровь, Аято понимает, что его мать — один из Мю. Вместе с Харукой они спешат уйти, оставляя за собой лишь вопросы и страх перед неизведанным будущим.