2035 год, Япония. Мир столкнулся с катастрофой, вызванной экспериментами над искусственными организмами. В результате взрыва в исследовательском центре один из этих организмов, названный Материей, вырвался на свободу и распространился по ущелью Куробэ. Правительство, опасаясь дальнейшего распространения, закрыло вход в город, который когда-то был символом надежды на будущее человечества.

Прошло два года. Пятнадцатилетняя Айко Татибана, потерявшая всю семью во время катастрофы, узнаёт от нового ученика, Юи Кандзаки, шокирующую правду о том, что произошло. Юи раскрывает ей секрет, скрытый в её собственном теле, и указывает на Первичную Точку — место, где всё началось. Чтобы разгадать тайну, Айко решает отправиться в запретную зону, сопровождаемая Юей и командой дайверов, экипированных специальными костюмами для выполнения миссий в опасной среде, заражённой Материей.

В глубине запретной зоны Айко и её спутники сталкиваются с непредсказуемыми опасностями и тайнами, которые могут изменить их представления о прошлом и будущем. Каждый шаг к разгадке приближает их к пониманию истинной природы Материи и роли, которую Айко играет в этом хаосе. В этом путешествии, наполненном страхом и надеждой, они стремятся не только выжить, но и найти ответы, которые могут спасти их мир от окончательного разрушения.