2071 год. Человечество расширило свои границы до самых дальних уголков Солнечной Системы, основав колонии от жаркой Венеры до могучего Юпитера. Однако, десятилетия назад, техногенная катастрофа уничтожила Луну, что привело к непредсказуемым последствиям. Непрерывные метеоритные дожди сделали Землю непригодной для жизни, а в первые же недели после катастрофы погибло почти половина человечества — 4,7 миллиарда человек. Выжившие, стремясь к новой жизни, переселились в колонии на других планетах.

Со временем, преступность в Солнечной Системе стала расти, и синдикаты, объединившиеся в мощные организации, начали контролировать многие сферы жизни. Для борьбы с этим угрозой правительство решило возродить древнюю практику охоты за головами. Так появились охотники, которые путешествуют по всей Солнечной Системе, преследуя самых опасных преступников. Среди них — Спайк Шпигель и Джет Блэк, два охотника с богатым опытом и своими тайнами.

Волею судьбы, Спайк и Джет оказываются на борту космического корабля «Bebop 268710», где их жизнь переплетается с Фэй Валентайн, очаровательной картёжницей с огромным долгом, Радикалом Эдвардом, юным гением компьютерных технологий, и Эйн, генетически модифицированной собакой с удивительными способностями. Вместе они становятся командой, путешествующей по бескрайним просторам Солнечной Системы, раскрывая тайны своего прошлого и сталкиваясь с новыми опасностями. Так начинаются их незабываемые приключения на борту «Bebop».